平成18年度、那賀川平野に広がる用水網は、「那賀川用水」として農林水産省が実施した「疏水百選」に選ばれている。徳島県では唯一の選定であった。
疏水百選は、日本の農業を支えてきた全国の代表的な用水の中から、110箇所を選定したものである。広く国民からインターネットとハガキ・FAXによる投票を受け付け、その後の選定委員会による評価と合わせて選定を行った。
那賀川平野の農業関係者からも多数の投票があったことであろう。
水路へ流れ込む生活排水や道路端から投げ込まれるゴミ ――― 他の多くの地域と同じように、この平野でも都市化や混住化が進むにつれ、あるはずのない光景が日常的な風景となってしまった。昔の用水路や自然河川を利用して整備された那賀川用水は、用水路と排水路が兼用となっており、水質は下流ほどに悪化し、稲作に支障をきたしている地区も少なくない。
また、川を治めたとは言っても、この地域の自然条件は変わるはずもなく、那賀川は今も数年おきに激しい牙をむく。
さらに近年、渇水が頻発するようになってきた。
こうした背景から、水利施設の抜本的改修を図る地元関係者の強い要望に応え、「国営総合農地防災事業」が採択された。農林水産省では平成8年度より事業を実施している。